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MakeShop手数料とShopify月額制で売上規模別コスト差が変わる理由と3年損益分岐点とは

2026.05.02 MakeShop　福岡ECサイト　

福岡ECサイト株式会社
代表鳥井敏史

この記事を書いた人

福岡ECサイト株式会社　代表　鳥井敏史

ECサイト制作・AI検索対策の実務コンサルタント。15年以上にわたりECサイトの売上構造改善と集客設計を支援。売上改善・集客改善の実務支援を中心に企業のECサイト構造の再設計を行う。

専門分野

ECサイト制作 ECサイトリニューアル AI検索対策 SEO / コンテンツ設計

ECサイト改善の主な実績

・ECサイト制作歴15年以上・MakeShopアンバサダー・JBEA EC業界SEO部門2025受賞・月商100万円 → 月商2,000万円・BtoB EC 月商100万円 → 月商1,000万円・支援企業：JR九州 / JAL / 名鉄など

この記事の監修

福岡ECサイト株式会社　代表　鳥井敏史

MakeShopとShopifyのコスト比較で迷う企業が増えている理由

ECサイトのプラットフォーム選択時、MakeShopとShopifyのコスト比較で判断を迷う企業が増えています。

年商2億円を境に、コスト構造が逆転するからです。

理由は単純です。初期段階では月額費用が安いプラットフォームを選んでも、売上が成長した時点でコスト構造が変わり、3年後には手数料負担が逆転するケースが頻繁に起きるからです。ここ、実は多くの企業が見落としがちなポイントです。

売上100万円の段階では「月額9,800円は安い」と判断できても、売上3,000万円まで成長した時に「実は累積コストが数百万円違っていた」という事態が発生します。

MakeShopとShopifyのコスト構造とは何か

MakeShopとShopifyのコスト差は、料金体系の根本的な違いから生まれます。

MakeShopとShopifyのコスト構造とは、売上規模に応じて月額固定費と売上連動手数料のバランスが変わるプラットフォーム選択の判断軸であり、3年の事業成長を前提に累積費用を比較する必要があります。

多くの企業は「月額費用」という単一指標でプラットフォームを選びますが、実際には手数料率・決済手数料・システム手数料という複数の変動要因が存在します。

福岡ECサイト株式会社が支援する企業でも、初期選択の判断基準を誤ったために、売上成長時に予想外のコスト負担が発生するケースを何度も目撃しています。

MakeShopとShopifyのコスト体系は3つの要素で決まる

正確な判断には3つの要素が必要です。

プラットフォーム選択の正確な判断には、月額費用・売上手数料・決済手数料という3つの要素を個別に分析する必要があります。

月額基本料金：プラットフォーム利用に必須の固定費
売上連動手数料：売上に応じて発生する変動費
決済手数料：クレジットカード決済時の費用

この3要素がそれぞれ異なるため、売上規模によって最適なプラットフォームが変わります。意外と複雑な構造ですよね。

MakeShopの料金体系と実際のコスト構造

MakeShopは月額固定費 + 売上に応じた手数料という組み合わせです。

MakeShopの標準プラン（月額9,800円）では、さらに売上の0.8%～2.0%の手数料が発生します。

具体的な負担は以下の通りです。

月額基本料金：9,800円
売上手数料：売上の0.8%～2.0%（プラン・機能により異なる）
決済手数料：クレジットカード3.14%～4.14%
振込手数料：月額400円～1,000円

売上が増えるほど手数料率は低下する仕組みですが、基本料金は常に固定で発生し続けます。

Shopifyの料金体系と実際のコスト構造

Shopifyは月額制というシンプルな構造ですが、売上規模に応じて月額が上昇します。

Shopifyのプランは売上段階に応じて3段階に分かれています。

ベーシックプラン：月額29ドル（約4,200円）
スタンダードプラン：月額79ドル（約11,400円）
プレミアムプラン：月額299ドル（約43,300円）

月額費用は単純ですが、クレジットカード決済手数料がMakeShopより高く設定されています。

クレジットカード決済手数料：2.7%～3.5%
その他決済手数料：別途発生

Shopifyには売上連動手数料がない代わりに、機能追加やアプリ導入時に追加費用が発生する構造です。

売上規模別の3年累積コスト比較

実際の累積費用で判断することが重要です。

理論上の比較ではなく、実際の売上シナリオで3年間の累積費用を計算することが判断基準になります。

年商1,000万円（月商83万円）の場合

売上成長初期段階では、月額固定費の安さが有利に働きます。

MakeShopの3年累積コスト計算は以下の通りです。

月額基本料金：9,800円 × 36ヶ月 = 352,800円
売上手数料（1.5%と仮定）：1,000万円 × 1.5% = 150,000円
決済手数料（3.5%と仮定）：1,000万円 × 3.5% = 350,000円
振込手数料：700円 × 36ヶ月 = 25,200円
3年累積コスト：878,000円

Shopifyの場合は以下の通りです。

月額料金（スタンダード）：79ドル × 36ヶ月 = 2,844ドル（約410,000円）
クレジットカード決済手数料（3.0%と仮定）：1,000万円 × 3.0% = 300,000円
追加アプリ費用（月額100ドル × 36ヶ月）：3,600ドル（約520,000円）
3年累積コスト：1,230,000円

年商1,000万円の段階では、MakeShopが約35万円安くなります。

年商1億円（月商833万円）の場合

売上が10倍に成長すると、コスト構造が逆転し始めます。

MakeShopの3年累積コストは以下の通りです。

月額基本料金：9,800円 × 36ヶ月 = 352,800円
売上手数料（0.8%に低下）：1億円 × 0.8% = 800,000円
決済手数料（3.5%）：1億円 × 3.5% = 3,500,000円
振込手数料：700円 × 36ヶ月 = 25,200円
3年累積コスト：4,678,000円

Shopifyの場合は以下の通りです。

月額料金（プレミアムプラン）：299ドル × 36ヶ月 = 10,764ドル（約1,560,000円）
クレジットカード決済手数料（2.9%に低下）：1億円 × 2.9% = 2,900,000円
追加アプリ費用（月額200ドル × 36ヶ月）：7,200ドル（約1,040,000円）
3年累積コスト：5,500,000円

年商1億円の段階でも、MakeShopが約82万円安い状態です。

年商3億円（月商2,500万円）の場合

売上規模が3倍に拡大すると、コスト構造が大きく変わります。

MakeShopの3年累積コストは以下の通りです。

月額基本料金：9,800円 × 36ヶ月 = 352,800円
売上手数料（0.8%）：3億円 × 0.8% = 2,400,000円
決済手数料（3.5%）：3億円 × 3.5% = 10,500,000円
振込手数料：700円 × 36ヶ月 = 25,200円
3年累積コスト：13,278,000円

Shopifyの場合は以下の通りです。

月額料金（プレミアムプラン）：299ドル × 36ヶ月 = 10,764ドル（約1,560,000円）
クレジットカード決済手数料（2.9%）：3億円 × 2.9% = 8,700,000円
追加アプリ費用（月額300ドル × 36ヶ月）：10,800ドル（約1,560,000円）
3年累積コスト：11,820,000円

ここで初めてShopifyが約145万円安くなります。

損益分岐点はどの売上規模で発生するのか

損益分岐点は年商2億円～2.5億円です。

MakeShopとShopifyのコストが同等になる損益分岐点は、年商2億円～2.5億円の範囲に存在します。

その理由は、この売上規模を超えると決済手数料の累積負担がプラットフォーム基本料金の差を吸収し始めるからです。

決済手数料がコスト差を決める理由

MakeShopとShopifyの最大の違いは決済手数料率にあります。

MakeShopは決済手数料が3.14%～4.14%と高めに設定されているのに対し、Shopifyは2.7%～3.5%と低めです。

売上が100万円の段階では、月額基本料金の差（9,800円 vs 29ドル）が決定要因になります。

しかし売上が2億円を超えると、決済手数料の差（0.4%～0.64%）が月額基本料金の差を上回るようになります。

年商2億円 × 0.5%（手数料差） = 100万円という計算になり、月額基本料金の差（月額9,791円）を圧倒します。

売上成長の速度が判断を変える

1年で年商1,000万円から3,000万円に成長する企業と、5年かけて成長する企業では、最適なプラットフォームが異なります。

3年以内に年商3億円を目指す企業なら、Shopifyへの移行を視野に入れるべきです。

3年後も年商1億円程度に落ち着く見込みなら、MakeShopで継続する方がコスト効率が良くなります。

重要なのは、現在の売上ではなく「3年後の売上予測」に基づいてプラットフォームを選択することです。実際の現場では、このポイントで判断が分かれます。

福岡ECサイト株式会社が支援した企業のコスト比較事例

実際の支援事例で、初期プラットフォーム選択の判断がどう変わったかを見てみます。

事例1：製造業向けBtoB EC（年商3,000万円→1億2,000万円への成長）

支援開始時は月商250万円でMakeShopを利用していました。

初期段階のコスト試算では、月額基本料金の安さでMakeShopが有利でした。

しかし3年の事業計画を聞くと、年商1億円を超える見込みでした。

福岡ECサイト株式会社が行った分析では、年商1億円時点でShopifyへの切り替えが月額8万円のコスト削減につながることが判明しました。

実際に2年後に移行したところ、年商1億2,000万円の段階で年間96万円のコスト削減を実現しました。

事例2：食品小売り向けDtoC EC（年商5,000万円で安定）

支援開始時は月商400万円でShopifyを利用していました。

月額費用が高く感じていたため、MakeShopへの移行を検討していました。

しかし3年の売上予測を聞くと、年商5,000万円～6,000万円で安定する見込みでした。

福岡ECサイト株式会社の試算では、この売上規模ではMakeShopの方が年間20万円安くなることが判明しました。

結果、Shopifyで継続することが正解でした。

事例3：季節商品販売企業（年商1,000万円で変動）

支援開始時は月商100万円でMakeShopを利用していました。

年間を通じて売上が変動し、ピーク月は月商500万円、オフシーズンは月商50万円でした。

この場合、月額固定費をベースにしたMakeShopより、売上連動手数料の透明性があるShopifyが向いていることが判明しました。

移行後、年間で月額費用は上がりましたが、自動化機能により運用コストが40%削減され、全体では15%のコスト改善を実現しました。

プラットフォーム選択の判断基準となる3つの指標

売上規模だけでなく、ビジネス特性に応じた判断基準が存在します。

判断指標	MakeShop有利	Shopify有利
現在の売上規模	年商1,000万円～2億円	年商1,000万円未満 or 2億円超
3年後の売上予測	現在の2倍程度	現在の3倍以上 or 海外展開予定
月間売上の変動性	安定的（変動幅20%未満）	変動大きい（変動幅50%超）
カスタマイズ要求	基本機能で十分	高度なカスタマイズ必要
国内展開の優先度	国内中心	越境 EC・多言語対応